藍綠藻傳感器是利用藍藻在光譜中有吸收峰和發射峰這一特性，在藍藻的光譜吸收峰發射單色光照射射峰這一特性，在藍藻的光譜吸收峰發射單色光照射到水中，水中的藍藻吸收單色光的能量，釋放出另外到水中，水中的藍藻吸收單色光的能量，釋放出另外一種波長發射峰的單色光，藍藻發射的光強與水中藍藻的含量成正比。該傳感器安裝簡單使用方便。